I am very new to coding and Mark, so I apologise in advance if this is a simple question.
Currently I am attempting to run a CJS model (null model to begin with).
My data was collected historically (2011-2017) at very unequal time intervals between primary sessions, additionally secondary sessions run for an unequal period of time.
My capture history (`ch`) is very large (n=2392 days) as is continuous with ‘0’s in-between primary sessions.
To account for this in my model, I calculated the time intervals between each primary session as per the number of discussions I have read online, example of what I have written in RMark:
I first specify the duration between each (primary?) occasion (in our case the number of days),
I then specify the vector in the process.data() function:
- Code: Select all
time.intervals <-c(0,13,55,44,52,26,50,35,146,63,92,45,91,9,57,12,104,109,60,98,99,49,140,48,123,83,97,87,51,39,184,92)
process=process.data(ch, begin.time=1, model="CJS", time.intervals=time.intervals)
I then get an error:
- Code: Select all
Error in process.data- Incorrect number of time intervals.
What am I missing here?
If anyone could post some example code for a similar issue, provide some advice or point me in the right direction I would be extremely grateful! I posted sample of my data also.
- Code: Select all
Date ID
24.01.2011 13
27.01.2011 14
10.02.2011 7
10.02.2011 8
14.02.2011 9
14.02.2011 10
15.02.2011 11
15.02.2011 12
12.04.2011 23
13.04.2011 24
13.04.2011 25
20.04.2011 26
20.04.2011 27
20.04.2011 28
4.06.2011 29
4.06.2011 30
4.06.2011 31
5.06.2011 32
5.06.2011 33
5.06.2011 34
5.06.2011 35
28.07.2011 15
28.07.2011 16
28.07.2011 17
30.07.2011 18
30.07.2011 19
30.07.2011 20
30.07.2011 21
30.07.2011 22
1.09.2011 1
2.09.2011 6A290D7
2.09.2011 6A2A31C
2.09.2011 6A29854
3.09.2011 6A2A7C0
3.09.2011 6A290D7
3.09.2011 6A2A31C
3.09.2011 6A29854
23.10.2011 2
23.10.2011 6A2A9D9
23.10.2011 6A2847F
24.10.2011 6A29854
24.10.2011 3
24.10.2011 6A2882F
24.10.2011 6A29854
24.10.2011 6A283B5
25.10.2011 6A2847F
25.10.2011 4
25.10.2011 6A2991C
1.12.2011 6A2847F
1.12.2011 6A29854
2.12.2011 6A29854
2.12.2011 6A2A31C
2.12.2011 6A290D7
3.12.2011 6A2A7C0
3.12.2011 6A29854
3.12.2011 6A2A7C0
3.12.2011 6A2A31C
4.12.2011 6A28670
10.02.2012 6A29854
10.02.2012 5
11.02.2012 6A2A7C0
12.02.2012 6A2A7C0
12.02.2012 6A28E80
12.02.2012 6A29854
10.02.2012 69C42F2
10.02.2012 6A283B5
11.02.2012 6A283B5
11.02.2012 6A2991C
12.02.2012 6
29.04.2012 6A28789
29.04.2012 6A2A800
29.04.2012 6A2A31C
30.04.2012 6A2B5A3
30.04.2012 6A29811
30.04.2012 6A29304
30.04.2012 36
30.04.2012 6A28789
30.04.2012 6A288C5
1.05.2012 6A2A5AD
1.05.2012 6A2B5A3
1.05.2012 6A2A800
1.05.2012 6A29304
1.05.2012 6A28BB3
1.05.2012 6A2A7C0
2.05.2012 6A28789
2.05.2012 6A2A7C0
2.05.2012 6A29811
2.05.2012 6A2A31C
2.05.2012 6A2A5AD
2.05.2012 6A28BB3
2.05.2012 6A29304
2.05.2012 6A290D6
2.05.2012 6A2AB20
2.05.2012 6A28942
2.05.2012 6A288C5
1.05.2012 6A28789
1.05.2012 6A2A31C
5.07.2012 6A28092
5.07.2012 6A2A800
5.07.2012 6A29304
5.07.2012 6A28BB3
5.07.2012 6A2A5AD
5.07.2012 6A2AB1C
5.07.2012 6A29B00
5.07.2012 6A2B418
7.07.2012 6A2A5AD
7.07.2012 6A29304
7.07.2012 6A28027
7.07.2012 6A28BB3
7.07.2012 6A29B00
7.07.2012 6A2A4B9
7.07.2012 6A289AF
7.07.2012 6A29BDE
7.07.2012 6A281DC
7.07.2012 6A29178
7.07.2012 6A28D24
8.07.2012 6A28789
8.07.2012 6A27F1D
8.07.2012 6A28A9F
8.07.2012 6A2A4B9
8.07.2012 6A28027
8.07.2012 6A29B00
8.07.2012 6A2A455
8.07.2012 6A28BB3
8.07.2012 6A2A5AD
8.07.2012 6A29811
8.07.2012 6A29304
9.09.2012 6A29304
9.09.2012 6A28BB3
9.09.2012 6A2A31C
9.09.2012 37
10.09.2012 6A27F9D
10.09.2012 6A29304
10.09.2012 6A28BB3
10.09.2012 6A29811
10.09.2012 6A2B310
10.09.2012 6A2A31C
10.09.2012 6A28A9F
10.09.2012 6A29BDE
10.09.2012 6A27F1D
10.09.2012 6A288C5
10.09.2012 6A29811
10.09.2012 6A27F9D
10.09.2012 6A28BB3
10.09.2012 6A28027
10.09.2012 6A28A9F
10.09.2012 6A2A31C
11.09.2012 6A29304
11.09.2012 6A28027
11.09.2012 6A2A31C
11.09.2012 38
11.09.2012 6A27F9D
12.09.2012 6A28BB3
12.09.2012 6A29304
12.09.2012 6A27F9D
12.09.2012 6A2A1A0
10.09.2012 6A2B422
10.09.2012 6A27F1D
10.09.2012 6A288C5
11.09.2012 6A2B422
11.09.2012 6A288C5
12.09.2012 6A28D24
27.11.2012 6A2A1A0
27.11.2012 6A28BB3
27.11.2012 6A29304
27.11.2012 6A28092
27.11.2012 6A2A31C
28.11.2012 6A28BB3
28.11.2012 6A29304
28.11.2012 6A299F7
28.11.2012 6A2A31C
28.11.2012 6A28A9F
29.11.2012 6A2A1A0
29.11.2012 6A29D60
29.11.2012 6A28BB3
29.11.2012 6A29304
29.11.2012 6A28092
29.11.2012 6A299F7
29.11.2012 6A2A31C
30.11.2012 6A28BB3
30.11.2012 6A28092
30.11.2012 6A2A31C
30.11.2012 6A29304
2.03.2013 6A29304
3.03.2013 6A28092
3.03.2013 6A27EEB
3.03.2013 6A29304
3.03.2013 6A2AB98
3.03.2013 6A27E1E
3.03.2013 6A2A916
3.03.2013 6A2B422
4.03.2013 6A28092
4.03.2013 6A29304
4.03.2013 6A2A31C
4.03.2013 6A27EEB
4.03.2013 6A27E1D
4.03.2013 6A288C5
5.03.2013 39
5.03.2013 40
5.03.2013 6A29304
5.03.2013 6A27EEB
5.03.2013 41
5.03.2013 6A27E1D
5.03.2013 42
5.03.2013 6A2B422
5.03.2013 43
5.03.2013 44
5.03.2013 6A29BDE
5.03.2013 45
15.03.2013 6A29304
15.03.2013 6A289AB
15.03.2013 6A27EEB
15.03.2013 6A2A31C
15.03.2013 6A288C5
15.03.2013 6A29BDE
15.03.2013 6A27F1D
15.03.2013 6A2A5FF
12.06.2013 6A2AABD
12.06.2013 6A28B9D
12.06.2013 6B35060
13.06.2013 6A28B9D
13.06.2013 6A27F1D
13.06.2013 6B35060
14.06.2013 6A27E1E
14.06.2013 6B35060
14.06.2013 6A288C5
14.06.2013 6A28B9D
14.06.2013 6A2AABD
27.06.2013 6A29906
27.06.2013 6A280E7
27.06.2013 6A2B422
27.06.2013 6A2AABD
27.06.2013 6A28B9D
30.06.2013 6A29FF4
30.06.2013 6A28370
30.06.2013 6A29883
30.06.2013 6A2AABD
30.06.2013 6A28B9D
27.06.2013 6A29304
27.06.2013 46
27.06.2013 6A27EEB
27.06.2013 6A28EF8
30.06.2013 6A289AB
30.06.2013 6A29304
30.06.2013 6A27EEB
30.06.2013 6A29386
30.06.2013 6A2A31C
12.09.2013 6A289AB
12.09.2013 6A29304
12.09.2013 6B35CED
12.09.2013 6A27EEB
12.09.2013 47
12.09.2013 6A2AEA3
12.09.2013 6B36A56
12.09.2013 6A2A31C
12.09.2013 6A29386
12.09.2013 6B34D54
13.09.2013 6B39C28
13.09.2013 6A289AB
13.09.2013 6A27EEB
13.09.2013 6B20CA4
13.09.2013 6B39A7A
13.09.2013 6A29386
14.09.2013 6A29304
14.09.2013 6A289AB
14.09.2013 6A27EEB
14.09.2013 6E20CA4
14.09.2013 6B35CED
14.09.2013 6B39A7A
14.09.2013 6A29386
21.09.2013 6B35CED
21.09.2013 6A27EEB
21.09.2013 6A289AB
21.09.2013 6A29304
22.09.2013 6B35CED
22.09.2013 6A289AB
22.09.2013 6A29304
25.09.2013 6A29304
25.09.2013 6A27EEB
25.09.2013 6B35CED
25.09.2013 6B39A7A
26.09.2013 6E229BB
26.09.2013 68289AB
26.09.2013 6B35CED
26.09.2013 6B39A7A
26.09.2013 48
26.09.2013 49
26.09.2013 6B35CED
26.09.2013 6A2A31C
26.09.2013 6A29304
26.09.2013 6A2AEA3
26.09.2013 6A27EEB
26.09.2013 6A29386
14.01.2014 6A283DA
14.01.2014 6A289AB
14.01.2014 6B39A7A